Kompetencje w zakresie zarządzania programem są bardzo szerokie – począwszy od jego opracowania, poprzez wybór projektów do dofinansowania [link do Kryteria oceny projektów], zlecanie płatności na rzecz beneficjentów i weryfikację poprawności ponoszonych przez nich wydatków, aż po całościowe monitorowanie postępów realizacji programu i weryfikację osiąganych celów.

Szczegółowy wykaz zadań wykonywanych przez Instytucję Zarządzającą  obejmuje:

1. Przygotowywanie propozycji kryteriów wyboru projektów do dofinansowania;
2. Wybór projektów do dofinansowania;
3. Zawieranie z wnioskodawcami umów o dofinansowanie projektu lub podejmowanie decyzji o dofinansowaniu projektu;
4. Zlecanie płatności na rzecz beneficjentów;
5. Zapewnienie aktualności i poprawności danych służących do monitorowania realizacji programu;
6. Pełnienie funkcji instytucji certyfikującej;
7. Prowadzenie kontroli realizacji programu, w tym weryfikacja prawidłowości wydatków ponoszonych przez beneficjentów;
8. Nakładanie korekt finansowych;
9. Odzyskiwanie kwot podlegających zwrotowi (np. środków niewykorzystanych, odsetek, należności do zwrotu w związku z nieprawidłowościami);
10. Ewaluacja programu;
11. Monitorowanie postępów realizacji programu;
12. Zapewnienie informacji o programie i jego promocja.

Instytucja Zarządzająca  w perspektywie 2014-2020 przekazuje część swoich zadań do realizacji Instytucjom Pośredniczącym. Ciągle jednak zachowuje pełną odpowiedzialność za całość realizacji programu.
Zasady działania i obowiązki Instytucji Zarządzającej zostały określone w ustawie z dnia 29 sierpnia 2014 r. o zasadach realizacji programów w zakresie polityki spójności finansowanych w perspektywie finansowej 2014 – 2020 (rozdział 4).
Kontakt do Instytucji Zarządzającej Regionalnym Programem Operacyjnym Województwa Zachodniopomorskiego 2014-2020